二連アーチが水面に映しだされて眼鏡の形となっていることから、1882年「眼鏡橋」と名づけられた。

1982年の長崎大水害で中島橋の6橋が流出する中、甚大な被害を被りながらも持ちこたえ流出を免れた。

興福寺2代住持唐僧黙子如定（もくすにょじょう）が寛永11年(1634)に架けたと、古来伝承されているが、寛文3年(1663)全市の大火で興福寺一山全焼の災に遭い、 市中の諸文書と共に証すべき記録が滅失しているので、 一部に異説もある。